home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00338 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.6 KB  |  54 lines
  1. *********************************
  2. * Uteroglobin family signatures *
  3. *********************************
  4.  
  5. Uteroglobin [1] is a protein that seems specific to lagomorphes (rabbit, hare,
  6. and pica) and which binds progesterone specifically and with high affinity. It
  7. may regulate  progesterone concentrations reaching the blastocyst. Uteroglobin
  8. is also  a  potent  inhibitor of phospholipase A2. It is a protein of 70 amino
  9. acids that    form  antiparallel  disulfide-linked  dimers.  The progesterone-
  10. binding site is formed by a cavity between the monomeric subunits. A schematic
  11. representation of the location of the two disulfide  bonds in the antiparallel
  12. dimer is shown below:
  13.  
  14.  NH2-xxCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCx-COOH
  15.        |                                                              |
  16.  COOH-xCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxx-NH2
  17.  
  18. Two proteins are known to be structurally related to uteroglobin:
  19.  
  20.  - Clara  cell  10  Kd  secretory  protein  (CC10)  [2,3].  CC10  is a protein
  21.    expressed by non-ciliated cells of pulmonary airway surface epithelium. Its
  22.    exact function  is  not  known.  CC10, like uteroglobin, is an inhibitor of
  23.    phospholipase A2.  It  binds  to  polychlorinated biphenyls (PCB). Rat CC10
  24.    binds strongly to progesterone while human CC10 binds only weakly.
  25.  - Domestic cat major allergen I chain 1 (fel DI) [4].
  26.  
  27. We derived  two  signature  patterns  specific to proteins that belong to this
  28. family. These  are  centered  around  the  two  cysteine  residues involved in
  29. interchain disulfide bonds.
  30.  
  31. -Consensus pattern: [GA]-x(3)-I-C-P-x-[LIVMF]-x(3)-[LIVM]-[DE]-x-[LIVMF](2)
  32.                     [C is involved in an interchain disulfide bond]
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Consensus pattern: [DE]-K-I-x(2)-S-x-L-C
  37.                     [C is involved in an interchain disulfide bond]
  38. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  39. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  40.  
  41. -Last update: October 1993 / Patterns and text revised.
  42.  
  43. [ 1] Bally R., Delettre J.
  44.      J. Mol. Biol. 206:153-170(1989).
  45. [ 2] Singh G., Katyal S.L., Brown W.E., Kennedy A.L., Singh U.,
  46.      Wong-Chong M.-L.
  47.      Biochim. Biophys. Acta 1039:348-355(1990).
  48. [ 3] Nordlund-Moller L., Andersson O., Ahlgren R., Schilling J., Gillner M.,
  49.      Gustafsson J.-A., Lund J.
  50.      J. Biol. Chem. 265:12690-12693(1990).
  51. [ 4] Morgenstern J.P., Griffith I.J., Brauer A.W., Rogers B.L., Bond J.F.,
  52.      Chapman M.D., Kuo M.-C.
  53.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:9690-9694(1991).
  54.